Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlirpQ9D8T7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SlirpQ9D8T7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms