Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8L0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8L0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms