Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fip1l1Q9D824 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fip1l1Q9D824 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms