Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slx4ipQ9D7Y9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slx4ipQ9D7Y9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms