Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc3Q9D6Y1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc3Q9D6Y1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc3Q9D6Y1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms