Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab11fip1Q9D620 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab11fip1Q9D620 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip1Q9D620 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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