Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Q9D5Q8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D5Q8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D5Q8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms