Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Efhd1Q9D4J1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efhd1Q9D4J1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms