Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp2bpQ9D4C6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp2bpQ9D4C6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms