Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Katnal2Q9D3R6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Katnal2Q9D3R6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms