Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5430402E10RikQ9D3N5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5430402E10RikQ9D3N5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms