Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nol3Q9D1X0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms