Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan11Q9D1D1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan11Q9D1D1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms