Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm12Q9D0R8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm12Q9D0R8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms