Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx17Q9D0I4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx17Q9D0I4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx17Q9D0I4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx17Q9D0I4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx17Q9D0I4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx17Q9D0I4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx17Q9D0I4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx17Q9D0I4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms