Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acer3Q9D099 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acer3Q9D099 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms