Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CrtapQ9CYD3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CrtapQ9CYD3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CrtapQ9CYD3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 570 ms