Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smc1aQ9CU62 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1aQ9CU62 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms