Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpb2Q9CQI7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms