Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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