Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms