Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rrbp1Q99PL5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Rrbp1Q99PL5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rrbp1Q99PL5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms