Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5rap3Q99LM2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms