Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms