Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gps1Q99LD4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms