Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Sirt1Q923E4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sirt1Q923E4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sirt1Q923E4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms