Protein–RNA interactions for Protein: Q922D4

Ppp6r3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r3Q922D4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r3Q922D4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp6r3Q922D4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms