Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha7Q91Y13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms