Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn8Q91VA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn8Q91VA3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms