Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc44a4Q91VA1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc44a4Q91VA1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a4Q91VA1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc44a4Q91VA1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc44a4Q91VA1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc44a4Q91VA1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a4Q91VA1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms