Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cabp4Q8VHC5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cabp4Q8VHC5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms