Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk4Q8VEJ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk4Q8VEJ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk4Q8VEJ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms