Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3il1Q8VDV3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3il1Q8VDV3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms