Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam20bQ8VCS3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam20bQ8VCS3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms