Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc12Q8R344 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 652.8 ms