Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Alkbh3Q8K1E6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Alkbh3Q8K1E6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Alkbh3Q8K1E6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms