Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lrrc9Q8CDN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrrc9Q8CDN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrrc9Q8CDN9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrrc9Q8CDN9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms