Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Amigo3Q8C2S7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Amigo3Q8C2S7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms