Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc50Q810U5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc50Q810U5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms