Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ckap2lQ7TS74 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ckap2lQ7TS74 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms