Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed3Q78IS1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms