Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2r2Q6ZWZ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms