Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Syne1Q6ZWR6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms