Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neil2Q6R2P8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neil2Q6R2P8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neil2Q6R2P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms