Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc82Q6PG04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc82Q6PG04 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms