Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrt3Q6PE13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrt3Q6PE13 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrt3Q6PE13 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms