Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm29Q6PDI5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm29Q6PDI5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm29Q6PDI5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms