Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smchd1Q6P5D8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Smchd1Q6P5D8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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