Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BegainQ68EF6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BegainQ68EF6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1251.6 ms