Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt12Q64291 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt12Q64291 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms